プロジェクト：サービス全体
アプリケーション：サービスの一機能

django-admin startproject myproject
で、ディレクトリ、ファイルが作成される。

$tree myproject/
myproject/
├── manage.py
└── myproject
    ├── __init__.py
    ├── settings.py
    ├── urls.py
    └── wsgi.py

python3 myproject/manage.py runserver 0.0.0.0:8000
で、8000番ポートで待つサーバー起動。

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myproject/myproject/settings.py を編集。

データベースを、SQLite からMySQL へ変更。

DATABASES = {
    'default': {
        #'ENGINE': 'django.db.backends.sqlite3',

の前に pip をアップグレード。
pip3 install --upgrade pip

pip install django

$pip list
Django (1.10.2)
pip (8.1.2)
setuptools (18.2)