CentOS7 で、 RStudio https://www.rstudio.com/products/RStudio/ を使用するために、 R をソースからインストールしてみた。
いろいろ失敗を重ね、ネット上の情報を参考にした結果、 CentOS7 ミニマム インストール後に、 以下を実行する必要があるようだ。
yum upgrade yum groupinstall 'Development tools' yum install readline-devel yum install libXt-devel yum install zlib-devel yum install bzip2-devel yum install xz-devel yum install pcre-devel yum install curl-devel yum install java yum install java-1.8.0-openjdk-devel yum install texlive yum install texinfo
下のは、中国語のサイトを参照した。 perl-Digest-MD5 の必要性がよくわからない。
wget http://mirrors.ctan.org/install/fonts/inconsolata.tds.zip mkdir inconsolata unzip inconsolata.tds.zip -d inconsolata cp -r inconsolata/* /usr/share/texmf mktexlsr tee -a /usr/share/texlive/texmf-dist/web2c/updmap.cfg << EOF > Map zi4.map > EOF yum install perl-Digest-MD5 updmap-sys --force
ここまでで、coufigure は、とりあえず通るのだけれど、
R is now configured for x86_64-pc-linux-gnu Source directory: . Installation directory: /usr/local C compiler: gcc -std=gnu99 -g -O2 Fortran 77 compiler: gfortran -g -O2 Default C++ compiler: g++ -g -O2 C++98 compiler: g++ -g -O2 C++11 compiler: g++ -std=gnu++11 -g -O2 C++14 compiler: C++17 compiler: Fortran 90/95 compiler: gfortran -g -O2 Obj-C compiler: Interfaces supported: X11 External libraries: readline, curl Additional capabilities: NLS Options enabled: shared R library, shared BLAS, R profiling Capabilities skipped: PNG, JPEG, TIFF, cairo, ICU Options not enabled: memory profiling Recommended packages: yes
最後に表示される上記のようなメッセージの Capabilities skipped: PNG, JPEG, TIFF, cairo, ICU が問題。 追加で、以下を実行した。
yum install tcl-devel yum install tk-devel yum install libXmu-devel yum install libjpeg-turbo-devel yum install pango-devel yum install libtiff-devel
これで、Capabilities skipped:の項目はなくなった。 ※ yum の力で、依存関係のあるものが複数インストールされている。
R is now configured for x86_64-pc-linux-gnu Source directory: . Installation directory: /usr/local C compiler: gcc -std=gnu99 -g -O2 Fortran 77 compiler: gfortran -g -O2 Default C++ compiler: g++ -g -O2 C++98 compiler: g++ -g -O2 C++11 compiler: g++ -std=gnu++11 -g -O2 C++14 compiler: C++17 compiler: Fortran 90/95 compiler: gfortran -g -O2 Obj-C compiler: Interfaces supported: X11, tcltk External libraries: readline, curl Additional capabilities: PNG, JPEG, TIFF, NLS, cairo, ICU Options enabled: shared R library, shared BLAS, R profiling Capabilities skipped: Options not enabled: memory profiling Recommended packages: yes
Rのインストール
※ --enable-R-shlib は、RStudio 利用に必須。
wget https://cran.ism.ac.jp/src/base/R-3/R-3.4.4.tar.gz tar xvf R-3.4.4.tar.gz cd R-3.4.4 ./configure --enable-R-shlib make make install
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